Школа основана в 1990 году Православным братством «Радонеж». Она со дня своего основания была сориентирована на детей из православных семей, родители которых хотели бы, чтобы их ребёнок получал в школе и качественное образование с гуманитарным уклоном, и  православное воспитание.

Гимназия создана по благословению святейшего Патриарха Московского и всея Руси Алексия II. 

Приоритетным направлением педагогики в гимназии является духовное воспитание детей. Огромную роль в этом играют молитва, пост, участие учащихся в церковных таинствах. В гимназии действует свой гимназический храм во имя апостола и евангелиста Иоанна Богослова.

Весь распорядок в школе, весь уклад жизни гимназии соотнесен с годичным литургическим кругом Русской Православной Церкви, опирается на церковные традиции. В своей работе педагоги гимназии ориентируется на высокие современные требования, предъявляемые к качественному образованию  выпускников. Гимназия ставит своей целью воспитание детей в духе православия, формирование у них активной жизненной позиции, патриотизма и подготовку учащихся к ответственному социальному служению, на основе ясно осознаваемых ими традиционных христианских ценностей. 

В Православной гимназии «Радонеж» ряд предметов дети изучают углублённо. Среди них: Закон Божий, история, мировая художественная культура, иностранные языки, русская словесность, включающая в себя ряд самостоятельных дисциплин: литературу, русский язык, риторику, церковнославянский язык.