Храм построен в сер. XVII в. на месте встречи мощей свт. Филиппа во время перенесения из Соловецкого монастыря в Успенский собор Московского Кремля 3 июля 1652 г. Существующий ныне храм – яркий образец архитектуры раннего классицизма – был выстроен в 1777-1788 гг. (архитектор М.Ф. Казаков) на месте древнего каменного храма при сохранении его трапезной и колокольни постройки 1752г. Храм был закрыт в 1939г., но сохранил свое внутреннее убранство – иконостас, некоторые иконы, богатую лепнину. Храм возвращен Церкви и освящен в 1991г., отреставрирован в 1992-1997гг. Создание при храме Сибирского подворья стало воплощением идеи объединения регионов Сибири. В комплекс подворья входят: часовня в честь Просветителей земли Сибирской (прп. Германа Аляскинского, свтт. Иннокентия Иркутского, Иоанна Тобольского, Иннокентия Московского), представительский и паломнический корпуса. Проект Сибирского подворья стал дипломантом V Российского конкурса проектов на лучшее административное решение.